《规划》提出，“十一五”期，水运建设将形成以水运主通道为骨架，以区域性重要航道为依托，以一般航道为基础的通江达海的全省内河航道体系；完善港口布局，形成以枢纽港为中心，以区域性重要港口为依托，其他一般港口为基础的层次分明、功能完善、布局合理的全省港口体系。
具体规划为：与长江沿线六省二市合力建设长江黄金水道，重点建设九江港、南昌港；建设长江沿线瑞昌港、湖口港和彭泽港，赣江沿线吉安、新干、樟树、赣州港；开工建设赣江石虎塘航电枢纽；完成赣江南昌至湖口二级航道、樟树至南昌三级航道、吉安至樟树五级航道、樟树至南昌三级航道、吉安至樟树五级航道，赣江东河南昌经三江口至瓢山四级航道整治，江西省水上搜救中心和鄱阳湖分中心建设。启动袁河渠化建设工程前期工作。完成信江双港枢纽工程；信江双港至褚溪河口三级航道整治等。水运客货运场站发展纳入城市发展规划。
《规划》同时提出了实施保障要求，一是深化体制改革，推进交通运输市场化进程。增加建设投资；着重做好行业管理；建立企业法人治理机制；引入市场竞争机制。二是加强项目前期工作，提高项目决策的科学化、民主化水平。三是多方筹措资金，拓宽交通基础设施建设融资渠道。大力争取国家投资和国内外金融组织贷款，发挥各级政府、各类经济实体和广大群众办交通的积极性，继续实行各级政府安排配套资金的政策；坚持以市场化手段引进国内外资金，推进投资主体多元化，逐步建立起“国家投资、地方筹资、社会融资、利用外资”和“贷款修路、收费还贷、滚动发展”的多渠道投融资机制。盘活存量，变存量为增量，通过经营权转让等方式，筹集更多的建设资金。抓好交通规费和通行费的征收，提高融资能力。四是在积极盘活存量土地、闲置土地依法收回调剂使用的基础上，对全省重大交通建设项目用地优先供给。五是集中力量支持枢纽港港口、高等级航道及航运枢纽等重大交通项目建设。
据了解，“十五”期，江西省水运发展成绩显著，建成赣江樟树至南昌段五级航道93公里，南昌至湖口段三级航道156公里，吉安至樟树段五级航道151公里整治及南昌港集装箱码头等一批水运重点工程，77个内河港站项目竣工投产。全省航道通航总里程达5716公里，比2000年增加179公里。支持配合全省旅游产业发展，新余仙女湖、武宁湖、上犹陡水湖、会昌汉仙岩等重点风景区旅游码头相继建成投产，旅游客运泊位达22个，客运站点8个。
