2007年1月15日，中国民用航空总局杨元元局长与塔吉克斯塔国家航空公司总经理季洛耶夫在北京签署了《中华人民共和国政府和塔吉克斯坦共和国政府民用航空运输协定》。此次签署的协定将为中塔航空公司经营两国间航班奠定法律基础，有利于便利两国间人员往来，密切双方在经贸、旅游和文化等领域的交流和合作。
　　目前，南航经营乌鲁木齐——杜尚别航线，每周1班；塔吉克斯坦航空公司经营乌鲁木齐——杜尚别航线，每周1班。