据上海海关统计，2006年上海口岸农产品出口额计为27．6亿美元。其中，向美国出口4．3亿美元，增长14．8％，增速提高了14．5％；而此外向日本出口9亿美元，增长1．7％，增速回落9．8％；对欧盟出口4．2亿美元，增长16％，增速回落5．7％；对欧盟和香港分别出口2亿美元和1．4亿美元，增长4．5％和11．2％，增速分别回落4．2％和3％。
海关表示，我国是世界第五大农产品出口国，近年来随着我国农产品国际竞争力不断增强，农产品出口也取得了长足的发展，但由于国际社会对保护生态环境和食品安全的关注与日俱增，以及发达国家贸易保护主义抬头，技术性贸易壁垒的制度化趋势，我国农产品出口的市场准入门槛被不断提高。2006年1月欧盟实施的新食品法以及5月日本实施的《食品中残留农业化学品肯定列表制度》都给我国农产品出口贸易提出了严峻挑战。
据介绍，“十一五”期间，农产品被列为我国重点支持的出口商品，并于2006年下半年发布了首个关于农产品出口的五年规划，为了保持上海口岸农产品出口稳定的发展态势，不断提升出口效益，业内人士建议，农产品生产企业应该充分利用出口退税率调整的契机，发展农产品深加工产业，进一步提高深加工产品在农产品出口中的比重，优化出口产品结构。向规模化、集团化发展，提升抗风险能力；发展自有品牌，开发自主知识产权产品，提高核心竞争力；完善经营管理，在生产、流通及加工环节，推行标准化生产方式，建立质量安全管理体系，尽快与国际接轨，将技术壁垒对我国农产品出口的影响逐步降低。
