高速铁路南京南站和公路南京南站一起，共占地2平方公里左右，建成后将是京沪高铁全线规模最大的火车站。按照设计方案，南京南站为高架车站，站台在二楼，候车大厅在三楼，地面一层为换乘广场，广场中心区域有地铁一号线、三号线和六号线的进出站口；广场南侧有一个机场快客停靠带，高架路连通禄口机场；公路客运南站设在铁路南京南站的南广场。在这里可实现铁路、公交、地铁、长途客车和机场大巴的“零距离”换乘。 　　有关专家表示，南京南站建成后，除京沪高速铁路外，还将引入沪汉蓉(上海-南京-合肥-武汉-重庆-成都)铁路、宁安(南京-芜湖-安庆)和宁杭(南京-杭州)铁路，成为华东地区最大的交通枢纽。
　　伴随着南京南站大交通枢纽的建设，南京古城将明显向南发展。南京近年来发展的河西新区和江宁区将连成一片。南京城将在古城墙以外的广大区域快速发展，一个现代化的新区将与古城区一样成为城市的繁华区。