继上海、福建、大连、海南、广西等省的八个保税港区后，广州南沙港区成为广东省首个保税港区终获国家批准，广州南沙港也成为中国第9个保税港区，而深圳也接连获得国务院批准，成为中国第10个保税港区。 
广州市政府副秘书长唐航浩认为，广州南沙保税港的建立，能支撑珠江三角洲港口群的整体发展，对于完善珠三角港口群的保税物流体系，推动广东省加工贸易转型升级和开放型经济加快发展有重要意义。 
目前，广州南沙出口加工区首期工程已经通过国家海关总署等有关部门的正式验收，南沙国际物流园区一期项目已根据海关总署和广州海关的批覆按照「保税仓」和「出口监管仓」模式进行运作。南沙保税港建立后，就有利于在广州和珠三角中西部地区形成一个功能完备、辐射能力强的保税物体系。