2008年10月，深圳赤湾完成货物吞吐量474.4万吨，比去年同期减少7.9%。赤湾港区、妈湾港区完成集装箱吞吐量44.4万TEU，比去年同期减少19.4%，其中赤湾港区完成集装箱吞吐量31.7万TEU，比去年同期减少23.1%；散杂货吞吐量完成70.9万吨，比去年同期增长21.4%。2008年截至10月末，深圳赤湾累计完成货物吞吐量5411.0万吨，比去年同期增长9.5%，其中赤湾港区、妈湾港区累计完成集装箱吞吐量515.7万TEU，比去年同期增长2.6%。赤湾港区累计完成集装箱吞吐量365.1万TEU，比去年同期增长0.9%；散杂货吞吐量累计完成652.1万吨，比去年同期增长10.2%。