交通部于2006年颁布了《全国沿海港口布局规划》和《全国内河航道与港口布局规划》，对“十一五”期间的全国沿海及内河港口的建设与发展进行了规划。 　　《全国沿海港口布局规划》相关方案是：根据不同地区的经济发展状况及特点、区域内港口现状及港口间运输关系和主要货类运输的经济合理性，将全国沿海港口划分为环渤海、长江三角洲、东南沿海、珠江三角洲和西南沿海5个港口群体，强化群体内综合性、大型港口的主体作用，形成煤炭、石油、铁矿石、集装箱、粮食、商品汽车、陆岛滚装和旅客运输等8个运输系统的布局。
　　《全国内河航道与港口布局规划》旨在：规划内河高等级航道、主要港口，促进沿江、沿河产业密集区的形成，发挥区域内主要城市的经济辐射带动作用；形成由通航千吨级及以上内河船舶的高等级航道为骨干、主要港口为主体的全国内河航道和港口体系，促进运输船舶大型化、标准化，使内河水运资源得到有效开发利用，内河水运优势得以充分发挥；到2010年，航道通过能力可在目前基础上提高约40%；到2020年翻一番，船舶航行条件得到明显改善，单位运输成本将比目前明显降低，经济和社会效益显著。
　　沿海主要港口“十一五”发展规划
　　年 份 深水泊位 总通过能力 集装箱专业泊位
　　2005 1113个 25亿吨 5640万Teu
　　2010E 1752 46 13600
　　“十一五”总计新增 639 21 7960
　　2008－2010规划新增 13．5－14 4500－5000
　　“十一五”内河港口及航道布局规划
　　内河航道布局 形成长江干线、西江航运干线、京杭运河、长江三角洲高等级航道网、珠江三角洲高等级航道网和18条主要干支流高等级航道（简称两横一纵两网十八线）的布局。
　　构成我国各主要水系以通航千吨级及以上船舶的航道为骨干的航道网络，规划内河高等级航道约1．9万公里（占全国内河航道里程的15％），其中三级及以上航道1．43万公里，四级航道0．48万公里，分别占75％和25％
　　到2010年，内河航道通过能力可在目前（2006年）基础上提高约40％；到2020年再翻一番
　　内河港口布局 规划布局的内河高等级航道、主要港口遍及20个省（区、市），连接了50万以上人口的城市56个，占全国的25％，连接了国家一类口岸27个，占全国的29％。实现了主要资源地与消耗地的有效联接以及主要江河的干支直达和江海直达运输。