我国是畜牧业大国，但我国还不是畜牧业强国，畜牧业落后主要表现之一为物流的落后，畜牧业物流表现为典型的“物流二元倒挂结构”。这些年来，由于畜牧业先后经历了禽流感、口蹄疫、水旱灾害、市场供求与价格波动等一系列风险，使畜牧业这一弱势产业在发展过程中无暇顾及畜牧业物流业的发展，使畜牧业这一大产业始终难以成为强势产业，这与落后的物流有直接关系。实践证明，没有现代化畜牧业物流，就不会有畜牧业强国的出现。
　　畜牧业物流存在的问题
　　一、畜牧业物流的“二元结构”明显。当前城市农村的物流“二元化结构”明显，城市物流比较发达，农村物流相对比较落后，畜牧业物流更是落后。
　　畜牧业物流技术含量较高，需要越来越现代化的物流设施，而现在我国畜牧业物流相对落后，甚至与发达国家呈现差距不断扩大的趋势。
　　二、畜牧业第三方物流薄弱。我国第三方物流滞后，畜牧业的第三方物流相对更落后，表现为三个方面：许多畜牧业生产组织较小；许多物流企业不愿涉足畜牧业物流，导致畜牧业第三方物流不足，更不要说第四方物流；现有不多的畜牧业物流企业喜好“大而全”、“小而全”，不能够满足畜牧业生产性物流和居民消费性物流的需要。
　　三、畜牧业物流安全问题严重。畜牧业物流的食品安全性是一个较大的问题，近年来疯牛病、口蹄疫、禽流感等诸多食品安全问题严重影响了畜牧业物流的安全。
　　四、日本、欧洲等国的新技术性壁垒对中国畜牧业影响较大。今年以来，许多国家和地区加强了对中国畜牧业产品的技术壁垒门槛，如日本2006年5月29日正式实施肯定列表制度，药物添加剂限制种类由63种扩大到797种，将检验标准由2470个扩大到51392个。欧盟也实施了主要针对中国的新食品安全法规。因此，应采取提高畜产品物流质量的方法，应对日美欧等国家的技术壁垒，同时时刻监控外国对中国采取的措施，并组织积极反诉。
　　五、畜牧业物流多头分段管理的负面效应严重。畜牧业物流的多头管理，如农业、商业、工商、质检、交通等多部门对畜牧业物流进行分段管理，畜牧产品的生产、加工、流通、国内市场检疫、进出口检疫等环节分属五六个不同的主管部门，管理漏洞较多，造成在一些地方出现严重的“齐抓共管、齐抓不管”现象，甚至相互冲突，没有充分发挥行业协会的作用。
　　六、法律法规不完善。现有法律有《畜牧法》、《农产品质量安全法》、《动物防疫法》、《食品卫生法》、《生猪屠宰管理条例》、《兽药管理条例》等，目前尚无一部关于畜牧物流的管理法律，也没有形成畜牧产品物流的法律法规体系。许多发达国家和地区对畜牧产品的生产、加工、物流、销售等都制定了严格的法律法规，如德国规定，猪羊等从出生就要挂上相当于其身份证的耳标，由半官方的监督协会按官方的要求填写条形码，屠宰场对要屠宰的动物的耳标和条形码进行核对，不符合的不允许进入屠宰场。加拿大对禽畜产品经营企业有非常严格的注册程序，申请企业必须在申请书中详细说明生产经营环境。欧盟对运输活禽使用的车辆、司机培训、动物是否有足够的空间及饮用水等都有相应的规定。
　　加快畜牧业物流体系建设
　　畜牧物流的法律法规体系 不断完善现有畜牧物流法律法规，并使各种禽畜物流法律法规标准做到协调一致，逐步达到“无缝链接”的目标。
　　畜牧物流的标准体系 国际标准、国家标准、行业标准、地方标准、企业标准的完整体系和无缝链接，这需要有一个完善过程。
　　畜牧物流的信息体系  充分发挥计算机、网络等信息技术，使禽畜业产供销等物流信息得到较好的沟通，避免社会资源的浪费。在现代信息技术的基础上实现畜牧产品的商流、物流、信息流的统一与协调，特别是网上畜牧产品交易市场的探索具有重要意义，做到网上市场与网下市场的有机结合，可以充分发挥畜牧产品交易市场在配置资源中的重要作用。
　　畜牧物流的市场体系逐步完善现有禽畜产品的市场体系，如期货市场、批发市场（产地批发、中转地批发、销地批发、产销衔接区批发）、零售市场（菜市场、各类零售业态）的有机衔接，分别发挥各种禽畜产品市场的功能。
　　畜牧物流的通道体系 在现有“五纵二横”的基础上，不断完善全国性的绿色通道、省际间的绿色通道、省内的绿色通道的建设。进一步完善绿色通道，绿色通道是指不分品种、季节、路型，统一在收费口设立“绿色通道”标志，一律免收禽畜产品的过路费，尽量减免禽牧业生产、收购、运输、加工储藏等环节的各种费税。有关部门应采取切实有效的措施，积极治理禽畜产品物流中的乱收费，限制禽畜产品物流中乱收费的非市场化因素，完善禽畜产品物流的市场环境，实现禽畜物流企业的跨区经营。
　　畜牧物流的冷链体系 禽畜产品属于鲜活产品，具有价值低、易变质，生产具有周期性、季节性、区域性、技术性等特点，因此，应加强禽畜产品的冷链体系建设，并逐渐改善渠道上游、渠道下游的冷链延伸。
　　畜牧物流的检测体系 禽牧产品的检测具有十分重要的意义，是食品安全的重要环节，生产、采购、加工、储存、运输、销售等诸多环节都需要检测，且责任明确。但是在当前需要建立分层检测的第三方机构，改变传统封闭的大而全、小而全的检测机构和网络体系，第三方检测机构体系具有安全、有效、通达等要求，是社会大分工的结果。
　　畜牧物流的宏观调控体系 禽畜产品在农业产值中具有重要地位，在人们生活中具有重要地位，又是国家进出口的主要商品之一，因此，禽畜产品需要宏观调控，政府应该发挥应有的作用。如政府提供法律法规以及引导提供相应的标准体系建设，对产品的质量、价格、分销、储备等应进行相应的宏观调控，但不是干预，并对其产品的市场基础设施给予相应的政府支持，如通道、摊位区、超市区给予引导、示范，对食品安全进行管理。
　　应充分发挥各类行业协会在畜牧产品的生产、加工、流通、国内市场检疫、进出口检疫等方面的作用，协调各方利益，形成国际标准、国家标准、行业标准、地方标准、企业标准等的协调一致。
　　畜牧物流的产业链体系 禽畜物流基地、加工基地、运输系统、储存系统等形成产业链条，以达到精细管理的目标，畜禽产品的生产、流通、消费需要全程的绿色化作业，而某一个环节的缺少将会导致整个物流目标的丧失。无病疫区建设、“名特优新奇”绿色通道、屠宰点、加工点、配送中心、卖场等，形成“从田头到餐桌”的食品安全的产业链条。
　　畜牧物流的分销通道 物流分销指现货物流产品的流通过程，流通过程包括批发、零售以及过程中的仓储、运输等物流过程，需要引起人们的高度重视，忽视批发，或者忽视零售都是不可取的，应引起人们的重视。
　　畜牧物流的融资体系 畜牧产品的物流过程需要大量的资金，应采取农村政策性金融手段，如农业保险、农业担保、农业风险基金、农产品进出信贷款等多种工具，促进畜牧农产品的有效流通。