自2009年8月31日起，国航的两岸客运航班将由平日常态化包机改为定期航班。届时，国航经营的两岸航线将增加到6条，即：北京—台北桃园、上海浦东—台北桃园、成都—台北桃园、重庆—台北桃园、杭州—台北桃园、天津—台北桃园，计划每周执行27个往返班次。 
　　据了解，8月初，国航台湾办事处收到台湾“经济部”的核准函，8月13日，台湾“民航局”向国航台湾办事处颁发了营业执照——分公司设立运行许可证。自此，国航台湾分公司正式成立，国航成为首批获得台湾地区经营执照并投入运营的大陆企业之一。按照台湾方面的规定，分公司可在当地进行营销活动，而办事处是不能从事任何营业行为的。
　　国航这次开通两岸定期航班将在北京、上海、杭州等重点城市浓墨重彩，加大运力投入，将北京—桃园航线增至每天一班、上海—桃园航线增至每周六班、杭州—桃园航线增至每周五班。此外，国航还新增了成都—桃园的定期航班，以方便祖国大陆西部地区和台湾地区的沟通和交流。重庆—桃园和天津—桃园航线的航班密度也有所增加。另外，除保留原有特色的彩绘飞机以及空客340、330等机型外，国航还将投入波音777等宽体客机执行两岸航线，以满足不断增长的市场需求。国航将不断提高服务品质，为两岸旅客提供更加丰富的产品和满意的服务。
　　目前，国航在台湾地区已正式开通服务热线电话：+886-2-27182100 ，并使用中英文解答旅客询问。旅客也可以通过传真垂询：+886-2-27181900