对台小额贸易以其便利灵活的运作模式和高效快捷的通关效率，在“大三通”后优势不减，成为2009年两岸贸易的一大亮点。厦门海关统计显示，2009年头11个月，福建省对台小额贸易值1.1亿美元，同比增长51.5%。其中进口9093万美元，增长55.2%；出口1777万美元，增长34.8%。 
　　据了解，对台小额贸易货物主要通过台湾船舶在福建对台小额贸易点与台湾金、马、澎地区之间运输，然后由两岸物流公司发送到台湾本岛或大陆其他地区，是一种特殊的“快运”形式，其批量小、批次多、效率高、配送灵活，具有两岸直航之后的大规模航运所不具备的优势。在正常情况下，一批货物从台湾本岛经由小额贸易渠道进口，在登陆的第二、三天就能送到货主的手中，成熟的物流运作网络和“点对点”的快捷服务在两岸直航实现之后亦难以取而代之。