在上海经济结构调整的关键时期，上海海关结合地方特点，为上海率先实现产业结构优化和升级助“一臂之力”。上海海关相关负责人表示，在上海大力发展现代服务业之际，海关将积极参与，为企业服务好，坚决不当“旁观者”。
　　与被称为“白色污染”的传统一次性餐具不同，上海胜利医疗器械有限公司经营的一次性包装材料和餐具是由天然植物茫杆制成的，而且整个生产过程没有污染排放，属我国自主研发的绿色环保技术。2009年该产品成功打入海外市场，就在企业满怀信心准备大展手脚的时候，美国方面却传来了消息：此类产品要站稳市场必须通过美国食品包装行业的相关认证。要通过认证，企业必须投入大量资金改造工厂，由于该类产品当时出口退税率仅为5%，加之尚未完全摆脱国际金融危机的负面影响，胜利公司一度因资金问题陷入发展困境。一筹莫展的企业来到上海海关求助。海关专家敏感地认识到胜利公司所反映的不仅仅是一家企业的生存问题，而是关系到整个芒杆制浆技术行业的发展。为此，在为企业提供个性化政策服务的同时，上海海关从推动自主研发环保技术发展的角度出发，指导行业运用技术手段将芒杆浆料制品与普通木纤维制品区分，同时配合有关部门将芒杆浆料制品的出口退税率由5%上调至13%。从企业求助到海关调研，从海关提出政策调整建议到政策制定实施，前后用了不到两个月的时间。如此高效率出乎企业的预料，企业相关负责人说，真没想到反映和解决问题的渠道竟然如此顺畅，公司因此直接降低了约25%的生产成本，更主要的是政策”及时雨“让我们有信心立足这个行业做大做强。
　　由于税则调研所推动的税率变化可以带动整个行业的发展，因此近年来海关十分重视运用这一政策措施为先进制造业发展“加油”。“自2008年税则调研开展以来，上海海关提出的关税类建议被国务院税则委采纳的已达10余条，汽车、钢铁、能源、电子等诸多行业因此受益，对国家经济转型起到了积极作用。”上海归类分中心主任黄晓芸介绍道。上海归类分中心是上海海关具体负责税则调研的部门。除了税则调研，上海海关还在通关监管方面积极履责，多方支持船舶、钢铁等具有高增值能力的龙头企业由大变强。为配合上海打造船舶制造基地，海关开辟船舶行业绿色通道，构建无障碍信息通道，帮助企业分析业务需求并提出解决方案，为船舶加工企业办理通关业务提供便利。今年以来，上海浦东新区5家造船企业实现加工贸易进出口48亿美元，同比增长16.7%。上海海关还与上海宝钢集团公司完善新型伙伴合作机制，将宝钢列为分类通关改革首批试点企业之一，助企业提速降本，支持高附加值产品出口。
　　近年来上海服务外包平稳快速发展，服务外包已成为上海服务业的亮点之一。2009年上海服务外包合同金额17.62亿美元，同比增长20.8%；今年1-9月的服务外包合同金额达12.26亿美元，同比增长43.2%。与此同时，上海服务外包的企业数量持续增长、从业人员迅速增加，目前共有服务外包企业696家，比2008年底增加365家，其中不乏埃森哲、汇丰等世界500强企业在沪设立的亚太或全球数据处理中心，另外国内知名外包企业也以上海作为重要战略部署地，产业升级效应已经显现。为支持服务外包发展，上海海关主动作为，对服务外包进口货物实行保税监管，将保税监管和服务从“加工贸易”领域拓展到“服务贸易”领域。自今年1月生成全国首本服务外包保税监管手册至今，上海海关已受理多笔国际服务外包业务，截至目前已有5家企业备案了8本手册，备案金额逾2500万元人民币，涉及化学研究、医药生物、软件研发、电子设计、半导体研发等多个行业。
　　具有政策优势的海关特殊监管区域是带动地方产业转型升级的又一有力抓手。上海外高桥保税区是全国规模最大、成立最早的保税区，规划面积10平方公里，是上海国际贸易中心的重要载体。经过多年发展，保税区已逐渐形成医疗器械、工程机械、机电、汽车、钟表、医药分销、酒类、文化设备租赁等多个专业化贸易平台。为推动保税区聚集高能级贸易主体，使特殊监管区域成为跨国公司亚太地区的重要贸易节点，上海海关在给予通关便利支持发展的同时，积极探索创新专业商品展示交易平台的监管模式，通过不断提升通关效率以及加强海关技术指导，推动保税区成为上海进出口贸易的重要交易平台和服务长三角及全国的重要窗口，目前外高桥保税区内每平方公里的税收贡献已达23.4亿元。