近日，南沙保税港区信息系统正式上线启动，标志着保税港区的管理实现一体化、智能化的大飞跃。据悉，广州海关以2008《海关总署广东省人民政府关于建立署省紧密合作机制的合作备忘录》在广州签署为契机，两年多来落实合作备忘录中支持促进海关特殊监管区域和保税监管场所建设与发展，使保税物流成为广州加快经济发展方式转变、引领现代服务业发展的重要抓手。
广州南沙保税港区于2008年10月18日批复设立，是我国批准设立的第九个保税港区。为促进保税港区经济发展，用好国家赋予南沙保税港区的优惠政策，广州海关积极开展海关支持区域物流发展课题研究，探索促进特殊区域可持续发展道路，不断增强特殊区域发展动力。采用参加政策推介会、召开政策说明会、企业座谈会等形式，支持政府招商引资。同时制定特殊监管区域和场所的政策汇编和企业指南，使政府、企业充分掌握各类保税物流载体的有关政策、规定，提高海关执法透明度。
广州海关致力于优化海关监管模式，开发“广州海关特殊区域和保税场所监管系统”，实行集中报关、网上备案、以柜代仓、电子转关等高效便捷措施。开展分拨、配送、转口等新型业务，为企业提供个性化服务。统筹港口作业、保税加工、仓储物流业务，实现保税物流和保税加工管理的无缝对接。简化作业流程，做到“一次申报、一次查验、一次放行”。实施协管员管理模式，解决海关人力不足与日益增长的业务量之间的矛盾，提高通关速度，实现货物全天候进出。海关的一系列便捷措施吸引大批企业进驻，广东合捷、沙伯基础创新、出光塑料、日立工机等15家大型物流、生产企业先后落户南沙港区。据海关统计，2010年1月至11月，南沙保税港区保税货物进出区货值合计5.66亿美元。
广州空港保税物流中心（Ｂ型）运作后，广州海关积极对入驻中心企业开展政策指导，及时制定完善广州空港保税物流中心海关操作规程和企业办事指南，确保物流中心运作顺畅，同时以“封闭化、智能化、信息化、规范化”为原则，以信息系统为依托，探索建立“空港口岸-保税物流中心”无缝对接一体化运作新型管理模式，促进保税物流与口岸物流的有效联动。
空港保税物流中心（Ｂ型）依托大珠三角的区位优势和广州空港的国际枢纽作用，发挥其保税仓储、保税物流、国际中转、国际配送、国际采购等功能作用。特别是通过“入中心即退税”等政策优势的吸引，打造便捷的通关环境，降低物流成本，不少珠三角企业纷至沓来。目前有3家物流企业进驻，有３０多家企业有入驻意向，据统计，截至2010年11月30日，空港保税物流中心共进出货物重734.46吨，货值约145.5万美元。