广西北部湾经济区保税物流体系是中国南部沿海唯一的保税物流体系，是联系中国西南地区和东南亚国家的核心枢纽以及连接海港、空港和边境口岸的大型物流商贸基地。其运作模式是以北海出口加工区、钦州保税港区、凭祥综合保税区等为沿海沿边节点，通过南宁保税物流中心这一核心枢纽直接为西南地区乃至东盟国家的企业提供保税物流服务。目前，北部湾保税物流体系具备了码头作业、保税物流、出口加工等目前对外开放区域中的所有功能，将形成企业国际业务、系列优惠政策、生产要素等多方面的“集聚效应”。钦州保税港区首批5个入区项目的开工，标志着中国距东盟最近的保税港区进入全面开港运营阶段。