作为国家扶持的省、市重点建设项目，杭州农副产品物流中心建有农副产品交易、加工、仓储、配套4大功能区，具体分为粮油、蔬菜、肉类、果品、水产、副食品交易区、农产品加工仓储区、物流配送区、公共配套区等9大专业区块。2010年，九大市场实现交易额达166亿元，交易量246万吨。 
　　如今，在四大功能基础上，市场积极应用信息化技术和电子商务模式提升专业市场，促进有形市场和无形市场有机融合，完善现代物流市场、设施网络、信息三大体系，将生产、交易、运输、仓储、加工、配送、信息等服务有机结合，以期形成完整的供应链。这其中，主要通过构建基础设施、政策法规、管理服务、质量安全、信息网络和品牌营销六大体系实现转型升级。
完善的基础设施是市场硬实力的体现。除了提供优质的供水、供电、供气、道路、电信、宽带、排污、排水、垃圾中转站等基础配套，杭州农副产品物流中心还内设了接轨国家重点工程宣杭铁路复线的铁路专用线，拥有10个500吨级泊位的水运自备码头，并建有专门的公交中心站，开通了市、区共计4条公交线路。 
　　政策法规体系方面，作为国家支持的流通业结构调整国债项目、浙江省重点工程建设项目、浙江省“十一五”重大建设规划项目及余杭区战略发展重点项目，入驻企业享有税收、财政、产业等方面的优惠政策。同时，杭州农副产品物流中心管委会还针对大部分企业为市区整合提升而组建的新企业这一实际，切身从投资者的利益出发，以 “延续”、“统一”、“就低”为原则，和相关职能部门进行对接，明确了一系列优惠措施。
　　导报记者了解到，凡是入物流中心办事的投资者，均能享受到“一门受理、窗口运作、全程代理、限时办理”等周到、便捷、高效的人性化服务，以及道路保洁、绿化养护就、市场后期管理、安全保卫等物业服务。
　　更值得关注的是，中心还设立了专门的检验检测检疫机构，并逐步建立农产品质量安全预警系统，农产品质量追溯系统等长效、稳定的农产品质量安全管理系统，提高预防和控制能力。
　　近年来，为加快信息化系统建设工程，物流中心专门搭建了“配套网络平台”，进一步完善和推动电子商务平台的运行。专业的农副产品垂直领域电子商务平台想购网，解决了农副产品网上交易，使得消费者足不出户便可网购天下农副。官方电子商务综合数据管理平台“天下良仓”，则为政府、企业、金融机构、农产品经营者、消费者提供全方位的农产品数据服务，着力打造独具特色的农副产品网络商务系统，实现了信息和资源的共享。
　　在品牌营销方面，导报记者了解到，其逐渐完善统一的品牌形象识别体系、沟通传播体系，建立了规范统一的品牌形象。通过系统、多样的品牌推广措施，物流中心不仅提高了杭州现代都市农业综合体的知名度、美誉度，也逐步确立了“中心”“大、优、全、新”及“华东之最”的高端现代都市农业综合体形象。