对于出口日本的企业来说，近期担心的是运价。从15日开始，一集装箱运价从200美元翻倍到400美元。地震发生后，日本关闭了仙台港等几个中小佰口，东京、横滨、神户、大阪等大型港口处于正常运营或者恢复正常运营中；福岛核电站发生核泄漏后，东京与横滨的电力供应不正常，港口作业能力很差，导致很多货船和货物堆积在港口无法返回，影响正常的发货。

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由于日本震区港口比较混乱，当前部分出口企业的货只能发向大阪和名古屋，但这两个港口出现了货船积压，甚至出现无法卸货的现象。日本核辐射危害级别已调升到了最高，部分航运公司已不愿意再接赴日的订单，这也在一定程度上增加了船运的紧张程度。而日本柴油供应紧张导致其国内的物流也极不顺畅。业界表示，日本港口的混乱短期内难解决。以上种种，令出口企业担心增加运输成本。