新疆喀什经济开发区和喀什经济开发区兵团分区合作，对现有的喀什综合保税区投资开发有限公司进行重组，共建喀什综合保税区。双方经协商，成立喀什综合保税区建设领导小组，负责综合保税区重大问题的决策;在成立喀什综合保税区管委会前，成立综合保税区前期筹备工作小组，在综合保税区筹建期间处理相关工作。重组后的喀什综合保税区投资开发有限公司作为喀什综合保税区的建设和经营主体，注册资本7亿元，兵地双方各出资3.5亿元。