2013年7月6日，韩亚航空214号班机在美国旧金山国际机场降落过程中发生事故。机上乘客和机组人员共307人，其中乘客291人。141名中国公民中3名中国学生遇难。除了这起空难，1988年成立的韩亚航空还发生过两起空难事故。
    韩亚航空733号班机空难
    最严重的一起是发生在1993年7月26日。一架载有110名乘客和6名机组人员的波音737-5L9型客机，从韩国首尔金浦国际机场飞往全罗南道木浦的途中，当时的报告指能见度高，可是在空难发生前，天气却瞬间转坏，并刮起强风和下大雨。该航班曾两次尝试着陆都未能成功，到了第三次，机长尝试强行降落木浦机场的06跑道前，却意外撞向离跑道4公里外Mount　Ungeo的山脊处。飞机即时爆炸起火，造成机上66名乘客及2名机组人员死亡。
    这是波音737-500第一次发生坠机事故，亦是历来涉及737-500型客机的第二最严重事故，仅次于2008年9月14日发生的北俄罗斯航空821号班机空难。在当时，这亦是韩国本土史上第二伤亡最惨重的空难（韩国境内伤亡最惨重的空难是2002年4月15日的中国国际航空129号班机空难）。
    韩亚航空991号班机空难
    相对于韩亚航空733号班机空难，韩亚航空991号班机空难，由于是货运航班，造成的人员伤亡人数则少得多。991号班机空难发生于2011年7月28日。韩国当地时间2011年7月28日凌晨2时47分，一架波音747-48EF型货机由首尔仁川机场起飞，前往上海浦东，货机搭载58公吨货物，包括大批的手提电话、锂电池、半导体、发光二极管和液晶显示器等，余下货物则有树脂、油漆和其他化学品。
    4时03分，机长汇报指机舱发生火警，要求转飞济州并紧急降落。4时11分，航管中心与飞机失去联系，飞机其后坠毁于济州岛以西107公里海面。机组人员与上海航管部门最后的通讯内容是“机舱起火”。机上两名分别52和43岁的正副机长下落不明，二人飞行时数达19000小时，并有7000小时执飞波音747的经验。
    当日4时45分，韩国海洋警察厅派遣队伍前往搜救。6时10分，搜救队表示只找到了小量残余物如座椅、救生衣、有韩亚机身色彩的金属块和油污于海面漂浮，但飞机机体残骸仍未寻回。8月17日，搜救队确认了包括垂直尾翼在内的39件残骸的位置，约于水下80米，而垂直尾翼中可能包含了飞行记录仪和机舱对话记录器。两名遇难飞行员的遗体于10月29日寻获。（隋秀勇编辑整理）