台湾“交通部”面对岛内质疑，就修正有关“两岸海运直航许可办法”的规定出面辩护，称并无“国安”疑虑。
　　
　　根据修正办法，大陆船舶只要在24小时前填表报备，即可航经台湾限制或禁止水域。
　　
　　但据台湾媒体报道，这项修正案正遭到岛内法律专家的抨击。
　　
　　交通部为此出面辩解，称肯定会将军舰及渔船排除在外，仅允许渡轮与货船通过。
　　
　　此外，台湾还设置了7个检查站，大陆船舶必须经过其中1个才能继续通行。