广西自治区北部湾港口管理局从2016年1月1日起履行北部湾港口公共基础设施规划、建设和管理工作等职责。
　　
　　货物港务费是广西北部湾港公用基础设施维护的主要资金来源，北部湾货物港务费依据《中华人民共和国港口收费规则》征收，除外贸货物港务费50%(税后)返还码头所属单位，用于码头及其前沿水域的维护外，其余由自治区本级财政按规定安排用于港口公用基础设施的维护、管理支出。
　　
　　“十三五”期间，广西北部湾港公用航道养护290.8公里，维护及安全管理支出计划6.38亿元，年均1.27亿元。