上海市级各主管部门按照《上海市治理商业贿赂专项工作实施方案》和《本市开展政府采购领域不正当交易行为自查自纠的实施意见》的要求，认真开展自查自纠工作。
    上海市教委自查了2001年以来各预算单位涉及不正当交易行为的主要手段、方法和特点等，结合教育系统实际，明确重点治理范围为各单位和工作人员在图书教材、教具学具、学生生活用品、药品医疗器械、仪器设备等大宗物资和工程、服务的政府采购过程中，以各种名义暗中给予、收受财物或其他利益的不正当交易行为。
    上海市公安局在开展自查自纠的基础上，根据典型案例情况制定了《关于上海公安交通路政设施部门预防职务犯罪和治理商业贿赂犯罪专项工作的实施方案》，加强重点岗位监督，实施“分权制衡”，推行公开透明管理，加大监督检查力度。上海市检察院、市民防办和市文管委等部门也都根据自身工作实际开展政府采购领域治理商业贿赂工作。