5月12日14时28分，四川汶川发生8级强烈地震。地震发生后，重庆海关党组立即紧急传达海关总署和重庆市关于抗震救灾的紧急通知，采取多项措施全力以赴支持灾区抗震救灾。  　　加强抗灾组织领导 
　　为加强抗震救灾工作，重庆海关专门成立了抗震救灾工作领导小组，负责全面指挥、协调、处理涉及抗震救灾的重要工作；启动重庆海关应急预案，做好抗震救灾的防范和处置工作。15日、19日、20日重庆海关先后召开党组会、党组扩大会学习胡锦涛总书记、温家宝总理在灾区讲话精神，及时传达贯彻重庆市委市政府关于抗震救灾的紧急通知，部署抗震救灾工作。成立重庆海关抗震救灾工作领导小组，设立专门的抗震救灾值班岗位，要求把抗震救灾工作当成当前最重要和最紧迫的工作，动员全关干部职工积极地投入到抗震救灾的多项活动中去。 
　　“特殊党费”为灾区人民献爱心 
　　灾情发生第二天，重庆海关动员全关干部职工开展了“献爱心，与灾区人民心连心”紧急捐助活动，短短一天时间，就收到个人捐款50275元，随着灾情的进一步明确，灾区人民的巨大创伤和不幸遭遇不断牵动着广大干部职工的心。5月19日，重庆海关全体党员在原来捐款的基础上，又以交纳“特殊党费”的形式踊跃捐款，向灾区群众献上一份爱心。重庆海关一名离休党员听说消息后，19日一大早就早早的来到了重庆海关，向党组织交纳“特殊党费”，重庆海关在外地出差的党员听说消息后也立即委托家属向组织交纳“特殊党费”。重庆海关许多党员交纳了一个月的工资作为“特殊党费”，有的同志交纳了两个月的工资。重庆海关团员青年也响应机关党委的号召，以缴纳“特殊团费”的形式支援抗震救灾。许多群众包括合同工也积极参与到活动中来，进行了再次捐款。据统计，19日下午，重庆海关机关党委就收到“特殊党费”“特殊党、团费”和再次捐款达102367.06元。两次个人捐款共计152642.06元。此外，全关干部职工还以各种形式参与到全社会的救助活动中去，近70名干部职工报名参加无偿义务献血，许多同志参加了社会上的捐助活动，一些团员青年积极报名参加青年志愿者队伍。关员们纷纷表示，只要灾区人民需要，海关人随时都会伸出援手。 
　　“抗震救灾绿色通道”保障救灾物资及时运抵灾区 
　　为保障抗震救灾物资迅速运往灾区，重庆海关设立救灾人员、物资快速验放通道，由专人24小时检测、跟踪通关通道情况，为进出境的救灾、医疗队专家，以及救灾物资和载运物资的运输工具提供通关便利。 
　　5月15日，菲律宾著名华侨陈永栽先生捐赠四川地震灾区的500箱纯净水运抵重庆，对此情况，重庆海关特事特办，立即采用了“先登记放行，后补办手续”的应急方法，对救灾物资便捷通关，物资从飞机降落后20分钟内便装运上汽车驶往灾区。 
　　地震发生后，受困九寨沟的1000多名台胞获救后将乘坐六架次包机由重庆直接返台。这是重庆首次执行直航台湾包机。重庆海关设立专用通道，提前3小时开关并采取不间断通关的模式为台胞服务，简化返程台胞出境手续，增开特别通道，并组成欢送队伍，扶老携幼，主动为台胞排忧解难并给予情绪安抚，体现了两岸同胞“心连心共抗灾害”和“血脉相连浓于水”的亲情。5月16日18时20分至17日3时05分，636名台胞分坐台湾复兴、华航和长荣三个航空公司的直航包机陆续飞离重庆返回台北。在近9个小时的时间中，重庆海关的关员们始终保持了最优质、热情的服务，得到台胞们的高度赞誉。 
　　积极支持灾区企业快速通关 
　　地震发生以来，重庆海关全体工作人员24小时坚守岗位，全力保障四川灾区和重庆地区进出口通关。 
　　为保障抗震救灾物资迅速运往灾区，成都双流机场暂时关闭其他货物空运出境通道，原定由成都直航出境的快递货物受到影响。重庆海关与成都海关协商采取二次转关方式，将货物由汽车运输转关至重庆出境。成渝两关通过充分利用关区间互补的优势，成功解决了因成都空港运力压力过大导致出境快递货物搁浅问题。 
　　自灾情发生以来，重庆海关广大干部职工日以继夜，加班加点，以24小时不间断的高效、快捷通关服务先后验放救灾物资五批，救灾物品数十件次，救灾相关人员和境外媒体十余批五十余人次，台胞636人。为灾区进出口企业排除因地震带来的通关困难十余起，以实际行动保障了灾区企业的正常通关和灾后重建，支持了灾区抗震救灾工作。