两会双方敲定7月4日包机正式启航，初期航班暂定为每个周末18班次。奥运会后增加至每个周末72班次。大陆方面开放北京、上海、广州、厦门以及南京五个机场，台湾开放台北松山、桃园、台中、高雄小港、花莲、台东、澎湖马公、金门等八个机场。双方各有六家航空公司承担周末包机任务。 类似的情形都是以包机开始。 
　　周末包机化 台湾航空公司的巨大机遇
　　因为这是测试市场的需要，看看不同城市，不同航线的客流。心里有底才能开定期航班。长远看，大陆市场是巨大的，但目前各公司的判断是模糊的，以后全面开放大陆旅游，市场的信心才会更大。其中还有很多因素，需要逐步开始，目前的氛围很好，好的开始是成功的一半。
　　相对于之前的包机，意义完全不一样。因为之前是假日包机，但是除了春节，大陆和台湾的假期都不一致。这一次是周末包机，两岸的假期是一致的，所以客座率会大涨。
　　所以对台湾航空公司而言，益处是显而易见的：
　　1、有了大陆长期这个巨大市场，随着旅游的深入会给航空公司提供稳定的客源。
　　2、航程缩短。飞行更安全，因为飞机在空中减少空管的交接，减少起落等等。
　　3、航空公司的成本能降低，因为航程短了。另外，减少中转，航空公司的费用减少很多。对民众来说，机票价格一定会比原来便宜，省时、省钱，减少风险，这是三个好处。最主要是方便了两岸民众出行。
　　港澳航空公司：告别"中转" 港澳航线的前景将不可避免受到影响
　　两岸直航若最终确定，“港澳航线的前景将不可避免受到更大影响”。而那些“中转”机场，遭遇冲击将更为直接。此前，香港、澳门为台湾-大陆往来航班的主要中转地。
　　香港国际机场运营方——香港机管局表示，其暂时无法提供台港航班的具体数据。但有数据显示，作为台湾地区最大的航空公司，中华航空从台湾送往香港的旅客中，有至少60%的乘客最终目的地为大陆。在两岸直航后，对香港国际机场来说，此等客户将很难保留。
　　澳门国际机场专营有限公司市场部行政助理胡汉新则表示，此前澳门航空、新航与长荣航空均执飞由澳门中转至台湾的货运航线，但不久前，长荣航空结束了这一业务，并且，没有向机场方面解释原因。
　　而与此形成鲜明对比的是，台湾各大机场却已在直航的前景下，雄心勃勃地宣布其欲打造亚太中转枢纽的蓝图。
　　对香港、澳门航空公司而言：
　　1、短期看各航空公司还是会基本维持现状
　　2、长期看将告别“中转”，港澳航线的前景将不可避免受到更大影响
　　3、资源需重新分配
　　大陆航空公司：有机遇也有挑战
　　在包括航空公司、机场、物流企业等在内的整个产业链上，巨大的商业利益都将重新分配。
　　而原先，两岸航空公司间基于“中转”模式的合作计划，亦可能出现变化。
　　此前，国航方面已经证实其打算赴台设立办公室，并指其他航空公司也在作类似盘算，上述东航人士亦表示，不排除在5月20日后，在台湾设立办公地点，“甚至采取更进一步的措施来拓展台湾市场”。
　　冲击波：但积极的态度背后亦有担忧。
　　“但我们不认为这全然是利好消息，”这位东航人士说，“事实上，目前的节日包机，东航已经执飞了好几年，客座率当然是满的。但两岸直航后，由于成本在下降，票价也一定会下降，加上直航之后的客座率目前尚难预计，所以我们认为，直航对东航而言，与其说是利好，还不如说，仅仅是销售上的变局。”
　　他认为，在直航开通两岸数个机场航点后，以往集中的客座率也将被分散，东航和其他航空公司都需要研究，应如何提高客座率的问题。
　　事实上，国内航空公司在经营港澳航线上，已经面临增长率不佳的挑战。
　　国航2007年年报显示，其港澳地区客运量对比2006年出现了2.64%的下跌，港澳航班数目亦下跌5%；南航21日公布的2007年年报也表明，公司去年在港澳航线上的客运和货运周转量分别下降两成多和四成多，港澳起飞架次下跌一成多。
　　对内陆航空公司的影响：
　　1、有了台湾这个高端市场，随着旅游的深入会给航空公司提供稳定的客源。
　　2、航空公司的成本能降低，航程缩短。飞行更安全，因为飞机在空中减少空管的交接，减少起落等等。
　　3、港澳航线受影响，资源需重新分配