据民航局的统计，海南航空2010年10月1日—31日国内航班正常（准点）率为80.6%，名列大型航空公司（月航班量大于1万班）之首。
 “今年10月份，南方地区接连遭遇暴雨、台风等极端恶劣天气，给航班保障工作造成诸多困难。”海南航空运行控制部相关负责人表示，“在这种情况下，海航依然能够保持较高的航班正常率，凭借的是相对完善的运行管理机制和及时有效的应急处置。”
 据了解，在日常航班保障工作中，为提高航班准点率，海航建立了多项有特色的考核制度，将各生产部门、基地、营业部和境外办事处负责人纳入专项考核范围，根据航班正常性指标的累计完成率对相关人员进行奖惩，通过激励机制促进各单位持续保证航班正常率保持稳定水平。
 海航还建立了由公司分管运行的副总裁担任组长的专项工作组，推行航班延误整治每日预警制度。以15天为一个统计周期，发布分级预警，根据不同的预警级别，制定优先保障计划，统筹安排保障资源，对正常率较低的航班，从每日出港开始实施重点跟踪和整治。
 在遇到极端天气状况时，海航会启动各项应急处置程序。以“十一”长假期间海南地区的暴雨应急处置为例，海航运行控制部在严把放行关、确保运输安全的同时，积极联系气象部门实时跟踪降水趋势，及时发布相关信息提示，在满足运行标准的暴雨间歇时段调整出备份运力，力保旅客顺利出行。
 在今年第13号超强台风“鲇鱼”的防范工作中，海航密切关注气象动态，提前拟定并适时调整应急处置预案。海航签派控制中心根据风暴的风力大小、影响范围、即时方位、预计路径，分三级、二级、一级、特级四个级别，向公司各部门、东南沿海各基地持续发布《台风警报》。运行控制、飞行、机务、客服等部门根据不同级别的警报，及时调整处置策略，快速响应，在满足运行标准的地区正常进行航班放飞，在不具备条件航班起降条件的地区采取取消、兼并、延时或补班等举措，待台风过境后，及时调配运力，恢复航线畅通。