新世纪以来，南通狠抓产业结构转型，转变发展方式，一方面纺织等传统产业提档升级，增强了竞争力；另一方面海洋工程、新能源、新材料、生物医药、智能装备、节能环保、软件和服务外包等新兴产业迅猛发展，工业结构不断优化，实现历史性跨越。
依托中远船务、熔盛重工、明德重工等骨干企业，我市海洋工程产业位居全国第二，占全国海洋工程市场1/3份额；韩华新能源、欧贝黎新能源、强生光电等光伏企业和明阳风电等一批新能源企业具有较强的竞争优势，带动起一批产业链上下游科技企业；神马科技成为全球唯一能够向电网提供全系列复合绝缘子的厂家，中天科技在国内光纤行业名列前茅，新材料产业培育了一批拥有核心技术和拳头产品的龙头企业……战略性新兴产业风生水起，与传统产业携手发力，正成为南通打造长三角北翼经济中心的新引擎。
如果把纺织、船舶等传统产业比作经济发展的“原核”；海工、新能源等新兴产业就是加速运转的“新核”，从“原核”单跳变为“双核”齐跑，南通的经济转型之路走得更为顺畅、稳健、后劲十足。